Se llevó a cabo el sorteo de grupos para la próxima edición de Copa MX Apertura 2016, en el cual el torneo tendrá un nuevo formato.

El torneo ahora está conformado por 8 grupos de 3 equipos cada uno, y calificarán dos de cada sector, la fase decisiva empezará desde Octavos de Final en enfrentamientos a un partido.

El vigente monarca, Tiburones Rojos de Veracruz se ubicó en el Grupo Siete donde se medirá a Santos Laguna y Juárez. 

El recién ascendido a Liga MX, Necaxa, así como los nuevos conjuntos del Ascenso MX, Loros Colima, Potros UAEM y Tampico Madero no participarán en esta edición copera.

Tampoco estarán presentes los clubes de Primera División, Pumas de la UNAM, Tigres UANL, Monterrey y Pachuca, que jugarán la Liga de Campeones de Concacaf 2016-2017 y Atlas por ser último de la fase regular del torneo anterior.

Los grupos quedaron conformados de la siguiente forma:

Grupo 1: León, Atlante, Celaya

Grupo 2: Tapachula, Guadalajara, Chiapas.

Grupo 3: U.de G., Cruz Azul, Coras.

Grupo 4: Morelia, Oaxaca, Murciélagos.

Grupo 5: América, Mineros. Venados.

Grupo 6: Toluca, Lobos BUAP, Tijuana.

Grupo 7: Juárez, Santos, Veracruz.

Grupo 8: Dorados, Puebla, Querétaro.