Tras realizarse los partidos de Vuelta de la Fase Preliminar de la Copa Libertadores 2016, se definieron los Grupos de la competencia.

Los seis equipos que consiguieron su pase a la Fase de Grupos fueron: River Plate de Uruguay, Huracán de Argentina, Sao Paulo de Brasil, Racing de Argentina, Independiente de Ecuador y el Independiente de Santa Fe.

Los Grupos quedaron definidos de la siguiente manera.

Grupo 1:

River Plate (ARG)

The Strongest (BOL)

Trujillanos (VEN)

Sao Paulo (BRA)

Grupo 2:

Nacional (URU)

Palmeiras (BRA)

Rosario Central (ARG)

River Plate (URU)

Grupo 3:

Boca Juniors (ARG)

Bolívar (BOL)

Deportivo Cali (COL)

Racing Club (ARG)

Grupo 4:

Peñarol (URU)

Atlético Nacional (COL)

Sporting Cristal (PER)

Huracán (ARG)

Grupo 5:

Atlético Mineiro (BRA)

Colo Colo (CHI)

Melgar (PER)

Independiente del Valle (ECU)

Grupo 6:

San Lorenzo (ARG)

Gremio (BRA)

Liga de Quito (ECU)

Toluca (MEX)

Grupo 7:

Olimpia (PAR)

Emelec (ECU)

Deportivo Táchira (VEN)

Club Universidad Nacional (MEX)

Grupo 8:

Corinthians (BRA)

Cerro Porteño (PAR)

Cobresal (CHI)

Sante Fe (COL)

La primera Jornada se jugará la siguiente semana, teniendo actividad los equipos mexicanos el 17 de febrero con el juego entre Toluca y el Gremio de Brasil en el Estadio Nemesio Díez; mientras, el 18 de febrero en el Estadio Olímpico Universitario el Club Universidad recibe al Emelec de Ecuador.